Playlist

Cutting the DNA

by Georgina Cornwall, PhD

My Notes
  • Required.
Save Cancel
    Learning Material 2
    • PDF
      Slides 12 BiotechnologyRecombinantDNA Genetics.pdf
    • PDF
      Download Lecture Overview
    Report mistake
    Transcript

    00:01 Als erstes sollten wir uns die DNA-Restriktion ansehen. Wie bekommen wir verschiedene Stücke fremder DNA dazu, sich zu verbinden? Dazu werden Restriktionsenzyme oder Restriktionsendonukleasen benötigt.

    00:13 Wo finden wir Restriktionsendonukleasen? Sie stammen aus Bakterien. Bakterien benutzen Restriktionsendonukleasen, um eindringende DNA zu zerschneiden. So wie wir, können Bakterien durch Viren infiziert werden.

    00:29 Wenn ein Virus in ein Bakterium eindringt und versucht, seine DNA zu integrieren, beginnt das bakterielle Immunsystem zu arbeiten und zerhackt und zerstört die virale DNA.

    00:42 Somit kann diese nicht mehr effektiv in das bakterielle Genom integriert werden, ist nicht mehr wirksam und das Bakterium wird nicht durch die virale DNA beeinträchtigt. Das ist der Ursprung der Restriktionsenzyme.

    00:57 Wir verwenden diese Restriktionsendonukleasen oder Restriktionsenzyme als molekulare Scheren.

    01:06 Restriktionsenzyme sind molekulare Scheren, die DNA schneiden. Es gibt drei Arten.

    01:11 Typ II ist diejenige, die uns am meisten interessiert, da sie mit der größten Präzision schneidet.

    01:16 Schauen wir uns an, wie das geschieht. Auf der einen Seite haben wir das bakterielle Chromosom und auf der anderen Seite das Insulin-Gen, das wir bereits betrachtet haben.

    01:27 Typ-II-Restriktionsenzyme schneiden an versetzten DNA-Abschnitten, weil sie nach einer spezifischen palindromischen Sequenz suchen.

    01:41 Das ist die Sequenz, auf die sie in der bakteriellen Zelle spezialisiert waren.

    01:47 Palindromisch bedeutet, die Sequenz lässt sich rückwärts und vorwärts lesen.

    01:53 Die Sequenz AATT lautet auf dem komplementären Strang, in die entgegengesetzte Richtung gelesen, ebenfalls AATT.

    02:00 Das Restriktionsenzym EcoR1 stammt von E-coli und wurde zuerst entdeckt.

    02:08 So hat es seinen Namen erhalten. Es schneidet versetzt an beiden Enden der palindromischen Sequenz. Dadurch entstehen klebrige Enden. Die klebrigen Enden der beiden fremden DNA-Stücke sind komplementär zueinander sind. Deshalb lassen sich die Basen miteinander paaren. Eine Ligase verbindet daraufhin die Phosphat-Zucker Rückgrate.

    02:35 Hier können Sie sehen, wie die beiden Teile zusammengefügt werden.

    02:39 Nun haben wir ein rekombinantes DNA-Molekül. Meistens handelt es sich um ein zirkuläres Chromosom und ein fremdes DNA-Stück, das in dieses zirkuläre Chromosom eingefügt wird.

    02:50 Wir sehen jeweils zwei Abschnitte mit klebrigen Enden, durch die die Sequenz eingegliedert werden kann.


    About the Lecture

    The lecture Cutting the DNA by Georgina Cornwall, PhD is from the course Biotechnology.


    Included Quiz Questions

    1. Sticky ends are the regions of recombinant DNA that are spliced together.
    2. Palindromic sequences in DNA are recognized by restriction endonucleases to create sticky ends.
    3. Type III restriction endonuclease is the most precise.
    4. Restriction enzymes are most commonly used to insert bacterial DNA into human DNA.
    5. Sticky ends have to be methylated to attach to each other.
    1. The EcoRI enzyme helps eukaryotic cells to become immunized against viral attacks.
    2. EcoRI is a useful restriction endonuclease enzyme for gene-cloning procedures.
    3. The action of the EcoRI enzyme results in dsDNA fragments having sticky ends with 5′ end overhangs of AATT.
    4. EcoRI enzyme cuts the G/AATTC recognition sequence on the dsDNA that has a palindromic complementary sequence CTTAA/G.
    5. EcoRI was the first restriction endonuclease enzyme isolated from E. coli.

    Author of lecture Cutting the DNA

     Georgina Cornwall, PhD

    Georgina Cornwall, PhD


    Customer reviews

    (1)
    5,0 of 5 stars
    5 Stars
    1
    4 Stars
    0
    3 Stars
    0
    2 Stars
    0
    1  Star
    0
     
    cutting the dna
    By Jasmine M. on 27. September 2021 for Cutting the DNA

    in depth knowledge on DNA splicing, ecor 1 and so the base pairs want to stick together and then ligase comes along to stick together the backbones, the phosphate-sugar backbones. Here you can see how the two pieces come together and now we have a recombinant DNA molecule. Again, we are generally looking at a circular chromosome and a foreign piece of DNA being inserted into that circular chromosome and so we'll see two ends of sticky ends and insertion of that sequence.